В игре Crash Bandicoot: Mind over Mutant странным образом помолодевший Нео Кортекс в очередной раз планирует захватить мир. С помощью своего приятеля Н. Брио злодей реализуют черный замысел медленно, но верно. Для захвата мира используется новое дьявольское изобретение — устройство, рассылающее особенные текстовые сообщения, управляющие сознанием мутантов и самого героя‑бандикута. Крэш должен в который раз помешать чудовищным планам и спасти себя и своих друзей — титанов! В Crash of the Titans прирученное чудище отличалось чрезмерной чувствительностью: стоило Крешу оставить питомца, как тот, не пережив душевной травмы, погибал. В Mind Over Mutant появилась возможность хранить пойманных тварей в инвентаре, откуда их можно в любой момент извлечь.
Несколько новых способностей (возможность парировать атаки, умение копать и лазать по стенам), а также мультиплеер, позволяющий проходить игру вдвоем, — вот некоторые особенности проекта